Ang totoong mga dahilan para sa pagbaha sa Kuban, na kumitil ng daan daang buhay at sumira sa libu-libong mga bahay, ay hindi alam. Gayunpaman, maraming mga teorya sa iskor na ito, parehong opisyal at "tanyag".
Noong gabi ng Hulyo 7, nagsimula ang isang pagbaha sa Kuban, na sumira sa mga bahay sa Gelendzhik, Novorossiysk, Krymsk at isang bilang ng mga nayon. Sa sandaling iyon, nang lumitaw ang unang babala mula sa Ministry of Emergency Situations, ang mga nakaligtas ay nakaupo na sa bubong ng mga bahay, at ang mga matatanda, bata at may kapansanan na hindi makatakas ay pinatay. Ito ang katotohanang ito na nagpapahintulot sa amin na igiit na ang mga kinatawan ng Ministri ng Mga Sitwasyon ng Emergency ay bahagyang masisisi sa pagkamatay ng daan-daang mga tao, na hindi nagbabala tungkol sa sakuna sa oras at hindi nag-ayos ng paglikas.
Masyadong maraming pag-ulan ang sinasabing isa sa mga sanhi ng pagbaha. Ayon sa opisyal na pahayag, isang limang buwan na ulan ang tumama sa Kuban sa loob ng isang araw, na naging sanhi ng pag-apaw ng mga ilog at pagbaha sa mga lungsod. Lalo na naghirap si Krymsk, kung saan ang antas ng tubig sa ilang mga lugar ay lumampas sa marka ng tatlong metro. Napakalakas ng agos na ang mga kotse at maging ang mga trak ay napabaligtad ng presyur ng tubig.
Ang isang hindi opisyal na bersyon, na tinanggihan ng mga opisyal, ay ang tagumpay ng Neberdzhaevsky reservoir o organisado o awtomatikong paglabas ng tubig mula rito. Sa partikular, ang mga kinatawan ng Imbestigasyon na Komite ay pinamamahalaang maitaguyod na ang tubig mula sa reservoir ay talagang pinatuyo kapag nagsimula ang malakas na ulan, ngunit imposibleng masabing sigurado kung ano talaga ang humantong sa trahedya. Mayroon ding mga alingawngaw na ang kanal ay hindi awtomatiko, ngunit espesyal na inayos, dahil ang mga opisyal ay may pagpipilian: upang bahain ang Krymsk o payagan ang tubig na dumaan sa iba pang mga bahagi ng Kuban, kabilang ang lugar kung saan matatagpuan ang dacha ni Pangulong Putin. Ang bersyon na ito ay hindi nakumpirma o pinabulaanan.
At sa wakas, sinabi ng opisyal na teorya na ang pagbaha sa Kuban ay sanhi ng pagbuo ng mga lugar na madaling kapitan ng baha. Upang maiwasang maulit ang trahedya sa hinaharap, inatasan ang Gosprirodnadzor, Rosvodresurs at Roshydromet na gawin ang lahat ng kinakailangang hakbang. Napagpasyahan na ibalik ang mga hydrological post sa lalong madaling panahon, upang matiyak ang pinakamahusay na paggana ng mga meteorological station sa Krymsk at Novorossiysk, pati na rin upang gumawa ng mga hakbang upang maiwasan ang mga bagong natural na sakuna.