Ang pangatlong pelikula, Men in Black, ay isang sumunod na pangyayari sa sikat na komedyang Amerikano. Pinagbibidahan ng lahat ng parehong Tommy Lee Jones at Will Smith. Ang direktor ay muling kinuha ni Barry Sonnenfeld, executive producer sa likod ni Steven Spielberg. Ang pelikula ay nagsimula sa sinehan noong Mayo 23, 2012.
Ang papel na ginagampanan ng negatibong bayani sa oras na ito ay kinuha ni Jemaine Clement, ginampanan niya si Boris. Ito ang kriminal na nakatakas mula sa Lunar Prison. Nasusunog siya sa poot kay Agent Kay, na noong Hulyo 1969 ay nahuli ang salarin at iniwan siyang walang braso. Nang biglang malaman ni Kay na tumakas si Boris, nagpahayag siya ng labis na panghihinayang na noong siya ay naaresto ay hindi niya ito pinatay. Pagkatapos nito, nawala nang madali ang ahente, at ang kasosyo lamang niyang si Jay ang naaalala na mayroon siya. Ang natitirang tauhan na nakaitim ay nag-iisip na namatay si Kay sa komprontasyon sa ilang kriminal noong 1969.
Ang tanging paliwanag para sa ganoong kabaligtaran ng katotohanan ay isang pagbabago sa nakaraan. Nagpasiya sina Jay at Agent O na si Boris ay sangkot. Kinumpirma ito ng isa pang kaganapan ng isang cosmic scale - ang pagsalakay sa Daigdig ng lahi ng Boris. Sa dating katotohanan, imposible ito, dahil nag-install si Kay ng isang proteksiyon na aparato sa planeta na tinatawag na "ArkNet". Ngayon, na may kaugnayan sa pagkamatay ng ahente, maraming mga dekada na ang nakalilipas, ang Daigdig ay walang anumang hadlang mula sa mga kaaway sa kalawakan.
Natuklasan ni Jay na si Boris ay ipinadala ni Jeffrey Price, isang negosyanteng electronics na may iligal na oras na shifter sa kanyang arsenal. Ang ahente ay walang pagpipilian kundi maglakbay pabalik sa oras upang mai-save ang kanyang kapareha. At agad siyang inaresto ng batang Kay. Sa panahon ng interogasyon, sinabi sa kanya ni Jay ang lahat, at ang hinaharap na kasosyo ay naniniwala. Sama-sama nilang hahanapin ang Arkanian Griffin, na mayroong ArkNet. Ngayon silang tatlo ay nagpatuloy sa kanilang paglalakbay at umalis upang mag-install ng proteksyon sa buwan. Ngunit sa isang rocket sila ay inaresto ng koronel. Ngayon siya ay naging sikretong tagapag-alaga ni Jay.
Mula sa sandaling ito, mabilis na nabuo ang mga kaganapan. Ang mga bayani ay nakikipagtagpo sa dalawang Boris at isang away ang sumunod. Ang isang kriminal mula sa hinaharap ay itinapon sa rocket shaft, at ang batang Boris ay ipinadala pagkatapos niya. Ang proteksyon para sa Earth ay naitatag. At ngayon, tila, ang misyon ni Jay ay nakumpleto, ngunit ang isang batang kriminal na himalang nakaligtas ay lilitaw. Namatay ang koronel, ngunit nawasak din si Boris. At ngayon isang bagong character ang lilitaw sa pelikula. Ang isang batang lalaki ay bumaba mula sa kotse ng kolonel at sinimulang hanapin ang kanyang ama. Kinikilala ng ahente ang kanyang sarili. Bumalik si Jay sa kanyang oras at nakikipagkita kay Kay sa cafe. Bumalik ang lahat.
