Ang unang Russian tsar na hindi mula sa pamilyang Rurik, si Boris Godunov, ay namatay sa edad na 53 noong Abril 13, 1605. Ang kanyang kamatayan ay nababalot ng mga lihim, at hanggang ngayon ay nagtatalo ang mga istoryador tungkol sa kung ang kanyang pagkamatay ay natural o marahas.
Ipinapahiwatig ng mga dokumento ng Chronicle na sa araw ng kanyang pagkamatay ay mukhang malusog si Godunov, kumain ng masidhing gana at umakyat sa tore kung saan gustung-gusto niyang surbeyin ang Moscow. Pagkatapos ay bumaba siya mula sa kanya, nasusuka. Ang doktor na ipinatawag sa tsar ay walang nagawa, ang tsar ay dumugo mula sa kanyang tainga at ilong, di nagtagal ay wala na si Godunov.
Tulad ng isa sa mga kinatawan ng embahador ng Ingles na si Thomas Smith, na noong sandaling iyon sa korte ng autocrat ng Russia, ay nagsulat, naramdaman ng tsar, bukod sa pagduwal at sakit sa tiyan, at namatay bago dumating ang doktor.
Ang biglaang pagkamatay ni Boris Godunov, sakit sa tiyan ay nagbibigay dahilan upang maghinala na lason ang tsar. Ang kanyang kamatayan ay kapaki-pakinabang, una sa lahat, sa mga tagasunod ng Maling Dmitry I, na ang mga tropa ay papalapit sa Moscow sa oras na iyon.
Nagkaroon din ng bulung-bulungan sa mga tao na ang tsar mismo ay nalason sa isang kawalan ng pag-asa sanhi ng kanyang pagiging hindi popular sa mga tao, gutom sa bansa at ang trabaho ng mga taga-Poland.
Alam ang init ng ulo ni Boris, ang kanyang karakter, ang pagnanasa para sa kataas-taasang kapangyarihan, kung saan handa siya para sa anumang bagay (inakusahan siya na lason si Ivan the Terrible, ang pagpatay kay Tsarevich Dmitry, anak ni Ivan IV), at kung saan nakamit niya, na naging de facto pinuno ng Russia sa ilalim ng Fedor Ivanovich, maaari mong pagdudahan ang bersyon ng pagpapakamatay ni Godunov. Ang mamamayang Ruso, ang kanyang opinyon sa tsar, ay malamang, walang pakialam sa autocrat. Ang pagsulong ng mga Polyo sa buong bansa ay hindi rin nakakatakot sa tsar, sapagkat may mga mas masahol pa ring oras sa kasaysayan ng Russia, alalahanin natin, halimbawa, ang pagsalakay ng mga Mongol-Tatar patungo sa Russia.
Hindi dapat kalimutan na si Godunov ay madalas na nagkasakit kani-kanina lamang, at ang kanyang kamatayan ay maaaring resulta ng isang mahabang sakit ng autocrat.
